В 2006 году Северо-Кавказской железной дорогой получено дополнительно 12 млн. рублей дохода от перевозок грузов по договорам на особых условиях. СКЖД было заключено более 700 договоров на перевозку грузов на особых условиях. По сравнению с 2005 годом было задействовано на 10 тысяч больше вагонов и контейнеров.