Около 54 миллионов тонн составил объем погрузки на Северо-Кавказской железной дороге за 9 месяцев 2006 года, что почти на 5% превышает прошлогодние показатели. Рост погрузки достигнут за счет увеличения погрузки нефти, цемента, строительных грузов, промсырья, продуктов перемола, цветных металлов, продовольственных грузов.

За 9 месяцев 2006 года через припортовые станции дороги перевезено экспортных, импортных и транзитных грузов более 42 миллионов тонн. Рост объемов вызван увеличением грузопереработки в порту Новороссийск (на 1,1%), Ейск (почти на 48%), Кавказ (более чем на 26%), Темрюк (на 14%), Усть-Донецк (более чем на 18%). Начал осуществлять экспортные перевозки нефтепродуктов паром в порту Кавказ, в том числе с февраля по сентябрь 2006 года было перевезено около 510 тысяч тонн нефтепродуктов.