Грузооборот на Вологодском отделении за третий квартал 2006 года вырос на 4,5% к уровню прошлого года и составил 15 млрд. 800 млн. эксплуатационных тонно-километров. Постоянно увеличивается и средний вес поезда: за оцениваемый период он вырос 1,5% к уровню прошлого года и составил 3846,8 тонн. Оборот местного вагона вырос на 10%, производительность вагона и локомотива увеличились соответственно на 5,7% и 1,8%.

Специалисты связывают рост основных эксплутационных показателей с большими финансовыми вложениями в инфраструктуру Северной железной дороги. Только за 2005 год ОАО "РЖД" инвестировало в Вологодское отделение более 8 млрд. рублей. Эти средства были потрачены на строительство второго пути на участке Вологда – Буй, а также на удлинение путей почти всех ведущих станций.