Чистая прибыль "Трансгаранта" по МСФО в 2006 году составила 342.8 млн руб., что на 38% больше аналогичного показателя 2005 года. Выручка компании за отчетный период увеличилась на 12% до 4.13 млрд руб. Активы компании без учета рыночной переоценки основных средств на 31 декабря 2006 года составляют 7.2 млрд руб.

Грузооборот «Трансгаранта» в 2006 году по сравнению с 2005 годом практически не изменился и составил 24,8 млрд т/км. Погрузка сократились на 10,7% - до 16,1 млн тонн. Сокращение погрузки связано с постепенным переходом от маршрутных перевозок массовых грузов к повагонным перевозкам грузов в специализированном парке. Компания делает ставку на специализированный подвижной состав, видя в этом большие перспективы.